W ramach trwającego obecnie pierwszego etapu projektu dobiega końca wykonanie dokumentacji przedprojektowej obejmującej m.in.: wykonanie dwóch studiów wykonalności wraz z analizą środowiskową, opracowanie Opisu Przedmiotu Zamówienia będącego elementem Specyfikacji Istotnych Warunków Zamówienia (SIWZ) oraz dokumentacji przetargowej dla dokonania wyboru Wykonawców dokumentacji projektowej i sporządzenie Wniosków o dofinansowanie dokumentacji projektowej ze środków Unii Europejskiej. Koszt całkowity tej części projektu wyniesie 3 216 000 euro. Decyzją Komisji Europejskiej z dnia  20 grudnia 2006 roku, etap ten będzie w 85% sfinansowany ze środków Unii Europejskiej (Funduszu Spójności), pozostałe 15% zostanie pokryte z budżetu państwa.

Kolejne etapy modernizacji linii kolejowej będą obejmować opracowanie dokumentacji projektowej oraz wykonanie robót budowlanych. Zakończenie wszystkich etapów modernizacji linii kolejowej C-E 59 zaplanowane jest do końca 2020 roku.

Linia C-E 59 jest częścią sieci połączeń transeuropejskich, łączącą kraje skandynawskie
i nadbałtyckie, w tym port w Szczecinie z Europą Środkową i Południową.

PKP Polskie Linie Kolejowe S.A. dążą do zwiększenia wydajności sterowania ruchem kolejowym i bezpieczeństwa użytkowania torowisk. Zmieniona konstrukcja i geometria torowiska pozwoli na utrzymanie większej stabilności i wytrzymałości. Dzięki temu znacznie zwiększy się prędkość pociągów (pociągi osobowe będą osiągać 160 km/h, a pociągi towarowe – 120 km/h), co wydatnie skróci czas podróży na całej trasie oraz umożliwi kursowanie pociągów o długości nawet do 750 m.

Prace modernizacyjne nie obejmą tylko samych torowisk, ale także powiązaną z nimi infrastrukturę, tj. remonty stacji, wiaduktów drogowych i kolejowych, tuneli oraz montaż specjalistycznych elektronicznych  urządzeń  sterowania  ruchem  kolejowym.  Zmniejszy się
także ilość przejazdów tradycyjnych ze szlabanami, na rzecz bezpieczniejszych przejazdów dwupoziomowych. Pozostałe przejazdy zostaną wyposażone w „nadzór wizualny”
i nowoczesną sygnalizację. Perony zostaną przebudowane w taki sposób, aby wyeliminować wszelkie niedogodności architektoniczne związane z przemieszczaniem osób o ograniczonej sprawności ruchowej.

Ogromną korzyścią ekologiczną będzie zmniejszenie negatywnego oddziaływania
na środowisko naturalne. Wiąże się to z redukcją emisji zanieczyszczeń do powietrza
i wód, ograniczeniem hałasu poprzez wykorzystanie ekranów dźwiękochłonnych
oraz zmniejszeniem śmiertelności zwierząt. Na całej długości trasy zostaną zastosowane specjalne siatki ochronne oraz inne rozwiązania umożliwiające zwierzynie bezpieczne przekraczanie torów kolejowych, np. poprzez odrębne tunele. Równocześnie linia kolejowa zostanie dostosowana do sąsiadujących obszarów związanych z programem Natura 2000, tak aby kursowanie pociągów według nowych standardów nie zakłócało życia obszarów chronionych.